Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cnot1Q6ZQ08 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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