Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ino80Q6ZPV2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ino80Q6ZPV2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms