Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms