Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Znf653Q6YND2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms