Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssxb3Q6XAS4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ssxb3Q6XAS4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms