Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms