Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms