Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atp8b3Q6UQ17 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atp8b3Q6UQ17 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms