Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptx4Q6RUU0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms