Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms