Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms