Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 730 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrrn2Q6PHP6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms