Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scaf4Q6PFF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scaf4Q6PFF0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms