Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vstm2lQ6PDS0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms