Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trak1Q6PD31 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trak1Q6PD31 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms