Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Zbtb40Q6PCS8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Zbtb40Q6PCS8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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