Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCN7

Hltf, Helicase-like transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HltfQ6PCN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HltfQ6PCN7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms