Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gapvd1Q6PAR5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gapvd1Q6PAR5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms