Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slx4Q6P1D7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Slx4Q6P1D7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms