Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gpbp1Q6NXH3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpbp1Q6NXH3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms