Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc66Q6NS45 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc66Q6NS45 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms