Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sohlh1Q6IUP1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms