Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tpm4Q6IRU2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tpm4Q6IRU2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms