Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ParpbpQ6IRT3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms