Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Krt77Q6IFZ6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms