Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt40Q6IFX3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt40Q6IFX3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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