Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Hecw2Q6I6G8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Hecw2Q6I6G8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms