Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg9bQ6EBV9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms