Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nop58Q6DFW4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms