Protein–RNA interactions for Protein: Q6A028

Swap70, Switch-associated protein 70, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swap70Q6A028 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Swap70Q6A028 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Swap70Q6A028 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms