Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZT1

Fan1, Fanconi-associated nuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fan1Q69ZT1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fan1Q69ZT1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fan1Q69ZT1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms