Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Zcchc2Q69ZB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms