Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdk13Q69ZA1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdk13Q69ZA1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms