Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Pkp4Q68FH0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkp4Q68FH0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkp4Q68FH0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkp4Q68FH0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Pkp4Q68FH0 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkp4Q68FH0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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