Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Fnip1Q68FD7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Fnip1Q68FD7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms