Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CltcQ68FD5 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CltcQ68FD5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms