Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Arhgef39Q66JY6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Arhgef39Q66JY6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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