Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80dQ66JY2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ino80dQ66JY2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms