Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc8eQ66JT1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrrc8eQ66JT1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms