Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Pan3Q640Q5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms