Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc18Q640L5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc18Q640L5 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
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