Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CochQ62507 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CochQ62507 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CochQ62507 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CochQ62507 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CochQ62507 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CochQ62507 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms