Protein–RNA interactions for Protein: Q62460

Gm20865, (clone BALB3N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20865Q62460 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20865Q62460 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms