Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp4Q62445 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp4Q62445 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms