Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nptx1Q62443 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Nptx1Q62443 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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