Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SypQ62277 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SypQ62277 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SypQ62277 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms