Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sall3Q62255 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Sall3Q62255 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sall3Q62255 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms