Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Kdm5dQ62240 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kdm5dQ62240 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kdm5dQ62240 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms