Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SnrpaQ62189 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnrpaQ62189 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms