Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ttf1Q62187 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttf1Q62187 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ttf1Q62187 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttf1Q62187 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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